Fakultas Ilmu Komputer Universitas Katolik Santo Thomas Sumatera Utara mengelola dua Program Studi Sistem Informasi – S1 dan Program Studi Teknik Informatika – S1. Semua Program Studi telah terakreditasi Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi. Sejak 2001, kurikulum yang digunakan adalah Kurikulum Nasional 1996. Sejalan dengan perubahan paradigma dari kurikulum berbasis keilmuan menjadi kurikulum berbasis kompetensi, maka pada tahun 2003 semua Program Studi Teknik Informatika memberlakukan Kurikulum Berbasis Kompetensi. Mengingat perkembangan teknologi informasi yang demikian cepat serta harus diikuti dengan tersedianya kualifikasi sumber daya manusia yang mampu menggunakannya maka pada tahun 2013 diberlakukan Kurikulum Berbasis Kompetensi 2008. Kedua Program Studi Sistem Informasi – S1 dan Program Studi Teknik Informatika menyediakan Mata Kuliah Pilihan, sehingga mahasiswa dapat memilih sesuai dengan minatnya sesuai dengan kebutuhan pasar kerja.